没过多久,因为提拔官员的事,寇准又在殿上和反对他意见的大臣争吵了起来,太宗不想将这件事情闹大,对寇准说:“你现在身为执事,在朝廷上与人争辩,太过失礼了。”但寇准仍然力争不已。第二天,寇准不肯服输,仍与人据理力争。这一次,太宗不高兴了,他说寇准:“雀鼠还能够知道看人脸色,更何况是人呢?”时任宰相的吕端更是站出来对皇帝说寇准“性刚自任”,应予惩治,宋太宗终于又把寇准逐出了京城,将他调到邓州(河南邓县)做了个小小的知州。
到了真宗朝,寇准再次被召入京城,并出任宰相。寇准在宰相任内,积极抗辽,功勋卓著,但由于他刚正不阿的性格,又有数次被罢官,后来,寇准被贬到雷州,最终病死在那里。
寇准逝世后,他的妻子将灵柩运到洛阳安葬。在经过湖北公安时,当地民众念及寇准的恩德,将竹子插在地上,上面挂祭物祭拜他,而后将竹子、祭物等焚烧。过了一段时间,焚烧祭物的地方竟然长出了竹笋,并蔓延成林。当地墨竹图卷(局部)人就在附近为寇准建立了祠堂,还把那些竹子称为“相公竹”。